ISDS zajišťuje ověřenou identifikaci odesílatele i příjemce a generuje důkazy o odeslání a doručení. V praxi nahrazuje část listinné pošty a zkracuje úkony mezi úřady, firmami i občany. Integruje se se spisovými službami a DMS, aby se zprávy automaticky zaevidovaly a dostaly do správných spisů. Prakticky to znamená správné nastavení notifikací, delegací a oprávnění, jinak hrozí zmeškání lhůt. Bezpečnost stojí na řízení přístupu, auditních stopách a ochraně proti phishingu a podvrženým schránkám. Provoz musí zvládat špičky a mít plán pro výpadky, včetně režimu náhradního doručení. Pravidla „fikce doručení“ vyžadují školení uživatelů a jasné interní postupy. Chyby v integraci nebo ruční obcházení systému končí právní nejistotou a dodatečnými náklady.
